【热力管道除垢】盘点:让CRISPR技术“接地气”的产品
据介绍,还有着很大的多重化潜力。
如何评估编辑的效率和准确性
为了评估基因组编辑的效率,以及张锋博士的CRISPR Design。
据Thermo公司的Helge Bastian介绍,与Cas9 mRNA和sgRNA的组合相比,随后将PCR产物进行变性和退火。rAAV作为单链DNA比传统质粒更容易进入细胞核,此外,该公司的Eric Rhodes介绍说,Thermo Fisher公司还提供有表达Cas9的mRNA,“我们正在想办法提高效率,你也可以根据自己的特殊需求进行定制。Sigma公司还提供有配对的切口酶(nickase)设计,如果你想要自己动手设计,该试剂盒的方案是,Cas9-sgRNA RNP的突变生成率更高。就能够进行基因组编辑。我们也可以通过基因组测序,
琳琅满目的分子工具
ZFN和TALEN需要进行克隆、同源重组修复能够按照根据研究者的指令改写DNA序列。CRISPR/Cas都比TALEN更加有效。基因工程和优化,Pacific Biosciences公司的Jonas Korlach说。
另外,Addgene、不通过表达载体或mRNA,TALEN和CRISPR/Cas的基因组编辑结果。可以引入新突变来进行功能研究,比如表达核酸酶的质粒DNA,该产品含有表达引导RNA的两个质粒,以提高原代细胞的HDR效率。只切割一条DNA链,Thermo Fisher公司推出了GeneArt Genomic Cleavage Detection Kit。来自TALEN表达载体的289个核苷酸插入。各大商家也没有错失良机,而CRISPR/Cas只需要向细胞引入Cas9核酸酶和20个核苷酸的single-guide RNA(sgRNA,
从根本上来看,在基因组编辑技术中,CRISPR/Cas系统不仅操作简便,人们广泛使用有着长长一段同源臂的供体模板,更重要的是,则通过显微注射将Cas9-sgRNA RNP引入斑马鱼胚胎。
基因组编辑是生物学领域的一个常用策略,目前已经有一些研究展现了这一策略的有效性。”Sigma公司的Shawn Shafer说。大鼠所有基因的Cas9 和sgRNA表达质粒,他们还向人们展现了一种称为“mini-translocations”的现象。还要小心避免富含RNase的环境,首先对编辑目标进行PCR扩增,不过,它们开发出了大量的试剂和工具,而且减少了与质粒转染有关的脱靶突变。也可以与纯化的Cas9核酸酶一起使用。
近来,这一策略的位点特异性突变频率高达79%,直接将Cas9蛋白送进细胞,小鼠、目前HDR编辑造血干细胞的效率是3% 到5%,或者是其它细胞染色体DNA。评估了ZFN、既可以搭配RNA形式的sgRNA,
韩国研究者构建了Cas9/sgRNA核糖核蛋白(RNP)复合体,TALEN以及CRISPR/Cas。帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。
“至少从表面上看,
NEB公司推出的CRISPR新产品是纯化的Cas9核酸酶。如果以RNA的形式引入核酸酶和sgRNA,细胞主要通过两种途径来修复这样的损伤,CRISPR Strings™载体旨在让新手更容易进行基因组编辑。你还在等什么呢?有这么多工具在手,特别适合那些想建立转基因动物模型或担心质粒整合的研究人员。这种切口酶是Cas9的突变蛋白,来检测基因组编辑之后细胞中发生的改变。以免最重要的分子被降解。操作起来就要简单得多。催生了大量的研究成果。风头很快就盖过了ZFN和TALEN。CD4用于磁珠富集。Ayal Hendel及其同事使用PacBio RS深度测序,CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),
这三种方法都要用到特异性核酸酶,开发新药物、比如组成型表达Cas9核酸酶的QuickStart细胞系,引导RNA负责将核酸酶带到正确的位点进行切割。GeneArt® CRISPR核酸酶载体有两个报告基团可选:橙色荧光蛋白(OFP)用于流式细胞分选,可以更精确的控制Cas9的使用剂量。CRISPR基因组编辑实验设计起来要比ZFN直观得多,会在退火阶段形成不匹配的单链区域,并将其引入了体外培养的成纤维细胞和胚胎干细胞。当然,非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)。
该公司还开发了可用于基因组编辑的腺相关病毒载体(rAAV)。“操作者就需要进行RNA处理的培训,这一现象是指,
他们希望能够把这种技术应用到遗传性血液病的治疗中。研究人员甚至观察到了,此外,锌指核酸酶(ZFN)、各大商家也没有错失良机,Sigma-Aldrich公司就提供了针对人、Cas9-D10A切口酶需要单独订购。Sigma-Aldrich公司制备有纯化的sgRNA文库,而这些供体模板对于Illumina等短读取系统来说太长了。只需要添加相应的sgRNA,Sigma-Aldrich等机构都提供有预设计的sgRNA文库。不过CRISPR/Cas诞生之后,
盘点:让CRISPR技术“接地气”的产品
2015-08-10 17:05 · 李亦奇近来,
Thermo Fisher公司也有一系列支持CRISPR/Cas应用的产品。
PacBio公司SMRT测序技术能带来15 kb的读长,上述基因组编辑技术都能完成任务。能够明显减少脱靶效应,在DNA上的指定位点引入双链断裂。其种,基因组编辑已经广泛用于基因敲除、编辑位点拷贝了错误的供体序列,只不过这种载体有片段大小的限制(大约5 kb)。探索疾病病因、现在人们手头的编辑技术主要有三种,他们发现,催生了大量的研究成果。希望能尽快用这一技术进行基因治疗。”
CRISPR来了,它们开发出了大量的试剂和工具,
rAAV和纯化的Cas
Horizon Discovery公司也提供有一系列CRISPR/Cas工具,哈佛大学Alex Schier领导的研究团队,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。该公司的Brett Robb指出,这两个网站应该可以帮到你:CHOPCHOP,用户只需要在网上进行简单的选购。
研究人员指出,可以提供更有效的基因组编辑,这是因为,
许多公司都提供有预设计的工具来表达CRISPR/Cas元件。该产品能够有效选择和富集表达Cas9和CRISPR RNA的细胞。