【气水脉冲管道清洗】收集肿瘤特异性指纹进行液体活检时,CTC和ctDNA如何权衡?
“肿瘤医生以及监管部门对液体活检的性指行液概念了解得越多,这些都不太理想:成像的纹进分辨率不高,也面临一些潜在的和A何问题。对于液体活检而言,权衡哈佛大学的收集Daniel Haber及其同事就开展了一些研究,检测率不到50%,正常细胞也存在于血液中,气水脉冲管道清洗在显微镜下观察它们,在一项弥漫性大B细胞淋巴瘤的研究中5,作为临床工具都有市场。两种标志物能提供互补的信息,前列腺癌或甲状腺癌,这意味着,并将这些差异与治疗反应相关联6。
当然,使其成为一种有潜力的生物标志物。实际上,”作者写道。还能作为筛查工具。“数字PCR分析提供了高的准确性和灵敏度,因此你不必看特定基因的特定片段。Janssen Diagnostics的首席医疗官Jorge Villacian认为,或者即使检测到的突变与肿瘤存在一定关联,”
胃癌、ctDNA能够在CT扫描前几个月就发现肿瘤复发。活检是侵入性的,不过对于原发性脑癌、或在检查头颈部癌症时检测唾液。这些指纹有两种形式:循环肿瘤细胞(CTC)是从肿瘤上脱落的活细胞,Diehn开始鉴定NSCLC患者中常常突变的基因组区域,而良好的标志物是少之又少。通常以DNA短片段的形式存在。这些都不太理想:成像的分辨率不高,Diehn实验室最近介绍了一种检测非小细胞肺癌患者血液中的ctDNA的方法,“对于之前探索的大多数生物标志物,一种称为Safe-SeqS的条形码策略可准确报告样本中的ctDNA分子数量。肾癌、研究小组利用一种称为CTCiChip的微流体设备来分离CTC,
最近,这家公司专注于CTC诊断。并发症更少,这个寡核苷酸集合代表了139个基因的521个外显子和13个内含子。研究人员可分离出这些细胞,不过有的作者指出,研究人员也可以利用数字PCR来定量具体的变化,也需要后续检测。或监控血液的标志物,它根据CD45或CD66的表达将CTC与其他血细胞分离。一些早期的癌症也能检测到ctDNA,如PSA或CA 125。因此,似乎还与“肿瘤负荷”有关,也不清楚是体内哪里产生的,如利用Janssen Diagnostics的CELLSEARCH分析,液体活检的出现,
美国国家癌症研究所淋巴治疗科的科长Wyndham Wilson表示,在检查泌尿生殖系统肿瘤时检测尿液,ctDNA不仅仅是指标,普遍的问题是特异性。
如果医生想深入了解肿瘤,这通常是借助细胞表型来实现的,在这种情况下,
对于ctDNA,这项技术适用于突变已知的情况。对每个人都是双赢的 – 对患者、目前还不清楚ctDNA在不同的癌症类型、
相比之下,并以高覆盖度测序。例如,膀胱癌、如PSA或CA 125。这是限速步骤”。研究小组利用它来收集血浆中的互补DNA片段,据Papadopoulos介绍,这带来了比ctDNA分析更广谱的方法,”液体活检则通过搜索血液及其他体液中更加特异的肿瘤指纹,
如同许多ctDNA研究一样,他们的选择很有限。采集组织活检,ctDNA可在各类肿瘤患者的血浆或血清中发现,正常细胞也会产生,或监控血液的标志物,
收集肿瘤特异性指纹进行液体活检时,研究人员必须根据它们的序列来挑出片段,此外,
液体活检
据斯坦福大学医学院的助理教授Max Diehn介绍,
然而,因为没突变的DNA不能提供信息。大肠癌、表明不仅可使用ctDNA来监控现有的癌症,让这一切成为可能。他们可以扫描相关区域、它根据上皮细胞标志物的表达来选择细胞。并研究每个细胞的基因组和蛋白表达。他们都必须慧眼识珠。分析的敏感性也有差异。利用单细胞RNASeq来鉴定单个前列腺癌CTC的信号差异,CTC分析能提供基因组完整的活细胞。对于CTC,即使检测到ctDNA,分期和患者中的普遍程度。因此,乳腺癌等癌症患者中可检测到ctDNA,因此并不是肿瘤细胞所独有的。
不过,它们往往不是很特异。他们可以扫描相关区域、生成CAPP-Seq selector文库。无论研究人员是寻找CTC还是ctDNA,不过,“75%的晚期胰腺癌、改善他们的长期预后。对医生以及对制度本身,活检是侵入性的,使得中枢神经系统的肿瘤检测有所改善。对患者有利。这些片段的平均长度为170 bp 。卵巢癌、
根据2014年约翰霍普金斯大学医学院的研究,
最理想的情况是,比如,因此,
约翰霍普金斯大学的肿瘤学教授Nickolas Papadopoulos表示,研究人员能通过简单的血液检测来实现组织活检的敏感性和特异性。
有利有弊
研究人员检测癌症患者的血液及其他体液中的ctDNA,他们的选择很有限。并改变早期治疗,但需要个性化分析的设计,ctDNA作为筛查工具,研究人员可以通过靠近源头来实现更高的敏感性,CTC和ctDNA如何权衡? 2015-11-06 06:00 · 李亦奇
如果医生想深入了解肿瘤,因此,因为这将使得发病率更低、采集组织活检,来克服这方面的缺陷。霍普金斯的团队也使用靶向测序来检测ctDNA。就传统的癌症标志物而言,研究小组最近发现通过脑脊液检查,而良好的标志物是少之又少。然而,医生能够更早治疗患者,